苹果手机的iOS系统提供了多种方式来加密应用软件，以确保数据的安全性。以下是一些常用的方法：

1. 使用密码或PIN码：这是最简单和最直接的加密方式。用户需要为每个应用设置一个独特的密码或PIN码，只有知道这个密码或PIN码的人才能解锁应用。这种方式适用于那些不需要高度安全的应用，如社交媒体、邮件等。

2. 使用Touch ID或Face ID：对于需要更高安全性的应用，如银行应用、支付应用等，可以使用Touch ID或Face ID进行加密。这种方式需要用户的生物识别信息，因此比密码更为安全。

3. 使用端到端加密：这是一种更高级的安全措施，可以确保数据在传输过程中不被第三方获取。这种方式通常用于企业级应用，如电子邮件、即时通讯等。

4. 使用VPN（虚拟私人网络）：虽然这不是直接加密应用软件的方式，但通过VPN可以隐藏IP地址，从而在一定程度上保护用户的隐私。这种方式适用于那些需要保护用户隐私的应用，如在线购物、网上银行等。

5. 使用iCloud加密：对于某些应用，iOS系统允许用户选择是否将应用数据存储在iCloud中。如果选择了iCloud加密，那么即使设备丢失或被盗，用户也可以通过iCloud恢复已加密的数据。这种方式适用于那些需要长期保存数据的应用，如照片、视频等。

6. 使用“查找我的iPhone”功能：如果用户不慎将手机丢失，可以通过“查找我的iPhone”功能远程锁定或擦除设备上的所有数据。这种方式适用于那些对数据安全要求极高的应用，如个人电脑、文件等。

总之，苹果手机提供了多种方式来加密应用软件，用户可以根据自己的需求和偏好选择合适的加密方式。同时，为了确保数据的安全性，建议用户定期更新iOS系统，并使用强密码或生物识别信息来保护应用软件。